Selamlar,
Burada asıl önemli olan kullandığınız .NET Core versiyonu nedir?
Gelelim sorunuza, EntityFramework Core EDMX database-first desteklemez onun yerine code-first migration yapabilirsiniz.
** Eğer .NET Core 3.0 sonrası bir versiyon kullanıyorsanız, EntityFramework 6 ile .edmx database-first mantığıyla istediğinizi gerçekleştirebilirsiniz. Visual Studio 2019 ile birlikte tabi.
Ayrıca, şu linke bakın bir derim, detaylı olarak açıklama ve adımları mevcuttur.